¡Descarga Análisis de mutaciones en aislamientos de SARS-CoV-2 en la secuencia de la proteína S y más Guías, Proyectos, Investigaciones en PDF de Biología solo en Docsity!
Universidad Pedagógica Nacional. Facultad de Ciencia y Tecnología. Departamento de Biología. Asignatura: Biología Molecular. Docente: Hugo Mauricio Jiménez. Estudiante: Alejandro Guerrero Bustos. TALLER MUTACIONES EN DIFERENTES AISLAMIENTOS DE SARS COV- 2 CON RESPECTO A LA SECUENCIA GÉNICA QUE CODIFICA LA PROTEÍNA S (SPIKE) 1) Compare las gráficas o las tablas obtenidas del análisis de los 4 aislamientos de SARS CoV- 2 con respecto a la secuencia génica que codifica la proteína S (Spike). MAPAS DE RESTRICCIÓN DE LAS 4 SECUENCIAS DE SARS COV – 2 ENIZMAS QUE CORTAN UNA Y DOS VECES LA SECUENCIA SARS-CoV- 2/Taiwan/C GMH-CGU- 03/
SECUENCIA – TAIWAN >MT370516.1:21561- 25382
- Enzimas que cortan una vez la secuencia.
- Enzimas que cortan dos veces la secuencia.
SARS-CoV- 2/Wuhan- Hu- 1
SECUENCIA – CHINA >NC_045512.2:21563- 25384
- Enzimas que cortan una vez la secuencia.
- Enzimas que cortan dos veces la secuencia.
SARS-CoV- 2/human/GR C/34_36284/ 2020
SECUENCIA – GRECIA >MT459832.1:21538- 25359
- Enzimas que cortan una sola vez la secuencia.
- Enzimas que cortan dos veces la secuencia.
ANALISIS DE LAS GRAFICAS OBTENIDAS DE LOS MAPAS DE RESTRICCIÓN
DE LAS CUATRO SENCUENCIAS DE SARS COV- 2 :
El análisis de los mapas de restricción permite identificar una gran variedad de enzimas que intervienen en los cortes de las secuencias de nucleótidos de cada uno de los 4 aislamientos de SARS CoV-2 con respecto a la secuencia génica que codifica la proteína S (Spike). En este sentido, por cada secuencia se realizaron dos mapas de restricción los cuales presentan las enzimas que cortan una y dos veces en la secuencia. Se logra identificar que las enzimas que cortan una vez en las secuencias de los 4 aislamientos de SARS CoV- 2 hay similitudes entre ellas, determinándose que los mapas de restricción son bastantes similares. En cada uno de los mapas de restricción se repiten varias enzimas a lo largo de las secuencias, especialmente en las enzimas que cortan dos veces. Cabe señalar que a partir de la observación y el análisis de los mapas se determina que hay cambios en la secuencia de nucleótidos de cada una de las secuencia analizadas, esto permite señalar que los cambios que se producen en la secuencias son posibles mutaciones que producen variabilidad genética. a. Busque una enzima de restricción que realice corte único en una o dos de las cuatro secuencias elegidas. No olvide presentar la secuencia de corte y la posición del corte. Debe ser la misma enzima de restricción la que trabaje en el ejercicio. Además, muestre evidencia del mapa de restricción de las 4 secuencias con esa enzima de restricción (recuerde que si no hay corte también se evidencia en la gráfica) PRESENTELO EN UN CUADRO. ENZIMA ELEGIDA CON CORTE UNICO EN LAS CUATRO SECUENCIAS DE SARS CoV- 2 ENZIMA SWAL SWAL (ATTTAAAT) recorta contundentemente en la posición 357 8 de las cuatro secuencias de SARS COV- 2
SARS-CoV- 2/human/GR C/34_36284/ 020
SECUENCIA – GRECIA >MT459832.1:21538- 25359
b. Identifique dos enzimas que cortan 1 o 2 de los aislamientos, pero en puntos diferentes. No olvide presentar la secuencia de corte y la posición del corte. Recuerde que debe trabajar las 2 mismas enzimas de restricción escogidas en todos los aislamientos. PRESENTELO EN UN CUADRO ENZIMAS QUE CORTAN DOS VECES EN LAS CUATRO SECUENCIAS DE SARS CoV- 2 NOMBRE DE LA ENZIMA
IMAGEN
ENZIMA ACCL
ACCL (GTMKAC) corta en la posición 866 (2 nt 5 ext) en las cuatro secuencias de SARS COV- 2
ENZIMA ACCL
ACCL (GTMKAC) corta en la posición 1588 (2 nt 5 ext) en las cuatro secuencias de SARS COV- 2 ENZIMA SMLL SMLL (CTYRAG) corta en la posición 1 744 ( 4 nt 5ext) en las cuatro secuencias de SARS COV- 2 ENZIMA SMLL SMLL (CTYRAG) corta en la posición 3730 ( 4 nt 5ext) en las cuatro secuencias de SARS COV- 2
5) Presente los pantallazos de los gráficos de dominios conservados obtenidos de la proteína original (sin mutación) y la proteína mutada. GRAFICOS DE LOS DOMINIOS CONSERVADOS DE LA PROTEINA S SIN MUTACIÓN. CLÚSTER Y JERARQUIAS DE SUBFAMILIAS DE LA PROTEINA S
GRAFICOS DE LOS DOMINIOS CONSERVADOS DE LA PROTEINA S CON
MUTACIÓN.
CLÚSTER Y JERARQUIAS DE SUBFAMILIAS DE LA PROTEINA S
