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Apuntes de Bioquímica sobre las Proteínas, Funciones, Estructura, Aminoácidos, Cadenas laterales, Propiedades de los aminoácidos, Propiedades ácido base, Curva de valoración.
Tipo: Apuntes
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¡No te pierdas las partes importantes!
1. Concepto e importancia biológica. Son los constituyentes químicos fundamentales de la materia viva no sólo por su abundancia, (constituyen casi la mitad del peso seco de la célula), sino también por la enorme variedad de funciones que desempeñan en la célula y fuera de ella. Presentan en su molécula, además de C, H y O, el N como elemento químico diferenciador. También son frecuentes en ellas P, S, e incluso Fe y Cu. Son moléculas de enorme tamaño (macromoléculas), de elevado peso molecular. Son polímeros, denominados polipéptidos, constituidos por la unión de unas moléculas denominadas aminoácidos, de los que existen en la naturaleza 20 unidades moleculares o monómeros diferentes. Algunos aminoácidos pueden ser sintetizados por las células humanas a partir de otros u otras moléculas diferentes, pero hay nueve (diez en el niño en crecimiento –también la arginina-) que deben ser ingeridos en la dieta, son los aminoácidos esenciales. Las dietas vegetarianas suelen tener déficit en estos aminoácidos por lo que es habitual incluir derivados lácteos para prevenir la malnutrición en estos casos. 2. Aminoácidos. Enlace peptídico.
2.1. Composición química de los aminoácidos. Los aminoácidos se caracterizan por presentar una función amina y una función ácido. Resultan de sustituir en un ácido orgánico un hidrógeno del carbono α, β, γ, etc., por una función amina. Los 20 aminoácidos que constituyen las proteínas son α-aminoácidos y poseen una estructura muy parecida: constan de una parte común y un radical variable:
NH 2 -NH 2 CH 3 - CH 2 - COOH H - Cα - COOH
propiónico CH 3
alanina
NH 2 -NH 2 CH 3 - COOH H - Cα - COOH
acético H
glicocola
En general:
NH 2
H - C - COOH
R
2.2. Propiedades de los aminoácidos. Derivan de su estructura química. Destacan dos propiedades:
2.3. Clasificación de los aminoácidos. Además de los grupos amino y carboxilo unidos al carbono-α, algunos aminoácidos poseen en sus cadenas laterales (R) otros grupos amino o carboxilo que también se ionizan y generan cargas positivas o negativas, respectivamente, que contribuyen a la carga neta del aminoácido y de la proteína que lo contiene. Según esto, se clasifican según las características del radical (R):
2.4. El enlace peptídico. Péptidos. Los aminoácidos pueden reaccionar entre sí (con pérdida de una molécula de agua), uniéndose mediante el denominado enlace peptídico , para formar péptidos. Se trata de un enlace amida, entre un grupo ácido y un grupo amino y puede ser hidrolizado a su vez, separándose los dos aminoácidos. El nuevo compuesto tiene un NH 2 libre correspondiente al primer aminoácido (grupo N-terminal), y un COOH libre que pertenece al último aminoácido de la cadena, a los que se pueden unir nuevos aminoácidos por medio de enlaces peptídicos y formar un dipéptido (dos Aa), tripéptido (tres Aa), oligopéptido (de dos a diez Aa), un polipéptido (diez a cien Aa o 5.000 de peso molecular) o una proteína (más de cien Aa). El enlace peptídico se estabiliza porque los átomos de carbono, oxígeno y nitrógeno comparten electrones, lo que hace que aparezcan dos formas resonantes, lo que le confiere dos características importantes:
3.3. Estructura terciaria. Aparece cuando la estructura secundaria de una proteína sufre dobleces y plegamientos tridimensionales, constituyendo formas de tipo globular. Precisamente de la estructura terciaria depende la función de la proteína, por lo que cualquier cambio en la disposición de esta estructura puede provocar la pérdida de de su actividad biológica. Los enlaces que mantienen la estructura terciaria se establecen entre las cadenas laterales de los aminoácidos, y son de varios tipos: covalente, como puentes disulfuro (-S-S-) entre dos cisteínas; y enlaces no covalentes como puentes de hidrógeno, fuerzas de Van del Waals, fuerzas de interacción hidrofóbica por atracción de grupos apolares, y enlaces de tipo iónico (o de atracción electrostática). Como ejemplo tenemos la mioglobina cuya función es la de almacenar oxígeno; emparentada con la hemoglobina, se halla en el músculo esquelético, especialmente abundante en mamíferos buceadores como focas, ballenas, cachalotes, etc. Otros ejemplos son las proteínas enzimáticas.
3.4. Estructura cuaternaria Sólo la presentan algunas proteínas y se caracteriza por la formación de oligómeros, es decir, agrupación de varias cadenas polipeptídicas iguales o muy parecidas, que interaccionan entre sí por enlaces débiles, no covalentes, por ejemplo la hemoglobina, que posee cuatro cadenas polipeptídicas globulares iguales dos a dos (dos α y dos β), las proteínas musculares, los complejos multienzimáticos, inmunoglobulinas, etc.
4. Propiedades de las proteínas.
4.1. Solubilidad. Las proteínas fibrilares son insolubles en agua. Las globulares, en cambio, si lo hacen pero, debido a su elevado peso molecular, al disolverse dan lugar a dispersiones coloidales. La solubilidad se debe a los radicales polares que establecen enlaces de hidrógeno con las moléculas de agua, formando una capa de solvatación; si ésta se pierde, se producirá una interacción entre las moléculas de proteína y precipitarán. La mayoría de radicales hidrófobos permanecen alejados de las moléculas de agua al quedar situados en el interior de la proteína.
4.2. Alteración de la estructura espacial: desnaturalización. Cuando a las disoluciones de proteínas se les somete a cambios de pH, a alteraciones en la concentración de sales, presencia de ciertas sustancias orgánicas, o la intervención de agentes físicos como variaciones de temperatura o descargas eléctricas, la estructura tridimensional de las proteínas se pierde, con la consiguiente pérdida parcial o total de su funcionalidad. Ello se debe a que los enlaces que mantienen la conformación globular se rompen y la proteína adopta una estructura filamentosa; entonces, las moléculas proteicas se unen entre sí dando lugar a grandes partículas que precipitan. A esta variación en la estructura tridimensional se le denomina desnaturalización y no afecta a los enlaces peptídicos. A veces, la recuperación de la conformación primitiva puede ser reversible y se denomina renaturalización. No obstante, en la mayoría de los casos la desnaturalización es irreversible. Al modificar el pH se altera la carga de los radicales, por lo que allí donde había atracción entre diferentes cargas, se pierde la interacción entre ambos radicales. Al estar las moléculas de proteínas hidratadas, si introducimos alguna sustancia menos polar que el agua pero que se mezcle con ella muchas de las moléculas que hidrataban la proteína son separadas por estas moléculas. Al aumentar la temperatura se incrementa la energía cinética de estas moléculas provocando la desorganización de la envuelta acuosa de las proteínas y su precipitación.
Si añadimos sustancias salinas provoca la rotura de los puentes de hidrógeno y las interacciones eléctricas y genera la agregación de las moléculas y su insolubilización.
4.3. Especificidad. Los glúcidos y los lípidos que aparecen en los seres vivos son prácticamente siempre los mismos. Sin embargo, las proteínas suelen ser específicas para cada especie. Esta especificidad se debe a pequeñas diferencias entre moléculas proteicas, que desempeñan idéntica función en especies diferentes. Tales diferencias se basan en la distinta situación o cambio de uno o varios aminoácidos que componen estas moléculas. Esta variabilidad en la estructura primaria hace que en ocasiones aparezcan diferencias entre proteínas pertenecientes a individuos de la misma especie. Al ser recibidas tales moléculas por otro individuo (transfusiones de sangre, injertos de piel, trasplantes, etc.), su organismo las considera extrañas y responde con reacciones de rechazo (reacciones del tipo antígeno- anticuerpo).
5. Clasificación de las proteínas. Se clasifican en dos grandes grupos: